硫化亚铁也可用于去除含有硒的废水，并且在一些工业过程中用于控制污染物的排放。不过需要注意的是，硫化亚铁在空气中容易氧化生成二价铁离子和硫酸盐等产物，在使用时需进行充分搅拌以确保其充分反应，并且需要注意对环境的影响。